Bối cảnh của trò chơi diễn ra sau những sự kiện của Generals gốc, mô phỏng tình hình thế giới trong một tương lai gần. Khi các lãnh đạo của thế giới đang ký một hòa ước nhằm chấm dứt tình trạng chiến tranh toàn cầu, một đợt tấn công khủng bố đẫm máu đã phá tan hội nghị và giết hết những lãnh đạo tham gia. Điều này khiến cả thế giới mất đi các chính trị gia, các nhà ngoại giao và các nhà hoạt động và chỉ có các Tướng quân của mỗi quốc gia là còn sống sót để diệt trừ hiểm họa khủng bố đang tàn phá thế giới.[3] Sắc thái của cốt truyện sẽ tỏ ra hiện đại và nghiêm túc hơn so với các nhánh Tiberian và Red Alert trước đó, với nhiều yếu tố "gai góc và dữ dội" nhưng vẫn mang đến các "hành động kịch tính đỉnh cao".[8]